离开开元寺，移步来到千年历史，中国最早的伊斯兰教清真寺——泉州清净寺。

泉州清净寺坐落在市中心涂门街中段上。始建于公元1009年（回历400年），历代屡有修缮，是体现泉州作为世界海洋商贸中心多元社群的代表性遗产要素，也是宋元时期远渡重洋来泉州经商的波斯、阿拉伯等地穆斯林商人及其族群的珍贵物证。它见证了10至14世纪泉州海洋贸易繁荣时期，中国与阿拉伯地区间密切的经济与文化交流。  

公元1009年，客居泉州的阿拉伯穆斯林出资，仿照叙利亚大马士革伊斯兰教礼拜堂的建筑形式，建造了一座名为“艾苏哈卜寺”的清真寺，又名“圣友寺”。1310年，来自波斯设拉子（今伊朗）的穆斯林重修了寺院，其风格受到波斯设拉子当地清真寺的影响，现在世人看到的就是重修后的遗存。 宋元时期，许多阿拉伯、波斯、中亚的穆斯林沿着海上丝绸之路来到泉州，人数多时修建的清净寺多达六七座。他们沿袭“围寺而居”的传统，围绕清净寺聚族而居，甚至形成独特的“穆斯林社区”。上千年来，穆斯林们在泉州自由地经商、传教、生活，不断推动泉州海上贸易的发展，成为古泉州港繁荣的一股重要力量；他们还与本地汉人通婚，在这片土地上繁衍生息，在融入本土文化的同时，也维系着自己固有的文化传统。  

14世纪末期，泉州地区由于战乱，伊斯兰教寺院荒废，穆斯林的朝拜活动受到影响。到了15世纪初期，明朝皇帝朱棣颁布了圣旨来保护穆斯林及其寺院，由此穆斯林后裔在泉州得到延续。 据悉，泉州现有阿拉伯血统的后裔数以万计，不少仍居住在清净寺周边，依然传承着伊斯兰风俗习惯，保留开斋节、主麻日礼拜及古尔邦节等节庆活动。多年来，清净寺等伊斯兰教遗迹吸引了大批海内外宾客和瞻仰者。  

清净寺是宋元时期泉州穆斯林商人及其族群的见证，这一群体是亚洲海洋贸易的主要参与者，是宋元国家口岸多元社会结构的重要组成部分。从建筑风格及元素上来看，体现了海洋贸易为泉州带来的人群汇聚和文化共存，这些多元文化因素极大地丰富了国家口岸城市的城市面貌和文化内涵。 清净寺也是宋元泉州外商聚居区的珍贵遗存，是商业性城区的重要地标，体现了宋元国家口岸城市独特的融合、发展过程。